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메이저 놀이터 순위트의 기원은 논란의 여지가 있으며, 지배 메커니즘은 여전히 불분명하며 기준 게놈의 연속성은 열악합니다. 고품질 게놈 시퀀싱, 완전한 게놈 어셈블리 및 게놈 전체 연관 분석을 통해 콩의 순응 메커니즘과 콩 육종의 개선에 대한 연구에 중요한 중요성을 제공 할 수 있으며, 다른 콩의 가축화 및 번식에도 도움이 될 수 있습니다.
최근 BGI와 공동으로 베이징 농업 대학의 메이저 놀이터 순위트 Research 팀은 중국 과학 아카데미의 유전학 연구소 및 발달 생물학과 긴밀히 협력하여 호주 및 기타 단위의 Modock University와 밀접하게 협력했습니다. 2 세대 및 3 세대 시퀀싱 기술을 사용하고 Hi-C 염색체 보조 조립과 결합 된 메이저 놀이터 순위트 Jingnong No. 6 게놈 시퀀싱 및 어셈블리가 성공적으로 완료되었습니다. 동시에, 322 메이저 놀이터 순위트 생식 질 자원이 재정비하고 있었고, 14 개의 농경질 적 특성 표현형이 확인되었고, 게놈 전체 연관 분석이 수행되어 다수의 후보 유전자를 수득 하였다. 관련 연구 결과는 Plant Biotechnology Journal (https://doi.org/10.1111/pbi.14337)에 게시됩니다.
게놈 업데이트는 염색체 수준에서 고품질 게놈을 얻었고, Contig N50은 약 16MB 였고, 서열 로딩 속도는 97.8%에 도달했으며, 32,738 개의 단백질-인코딩 된 유전자는 주석에 의해 얻어졌다.
그림 1 Jingnong No. 6 게놈 어셈블리
비교 유전체학은 유전자 패밀리의 진화와 포괄적 인 계통 발생 트리의 획득을 연구하여 메이저 놀이터 순위트와 11 개의 다른 종 사이의 독특하고 공유 된 유전자 패밀리를 식별합니다. 메이저 놀이터 순위트의 염색체 3 및 5는 골절과 융합을 겪었으며, 메이저 놀이터 순위트의 염색체 5는 Cowpea 속에 독립적으로 존재하며 별도로 길 들여질 수있는 중요한 간격을 가지고있는 것으로 밝혀졌습니다.
그림 2 작은 콩, 녹두 및 cowpeas의 비교 유전체학 분석
전체 게놈 재정의 분석은 322 개의 야생 콩, 반 야생 콩, 재배 된 콩 국소 품종 및 넓은 원천의 경작 콩에 대해 수행되었으며, 중국의 야생 콩은 유전 적 다양성이 높고 가장 원시적 인 유형임을 보여줍니다. 중국의 양호트 강의 중간과 하위는 콩의 기원과 길의 중심이되어야한다고 추측된다. 작은 콩의 포괄적 인 게놈 돌연변이 맵이 구성되어 작은 콩의 진화 및 가축화 패턴을 나타냅니다.
그림 3 322 야생 콩 및 재배 콩의 인구 구조 분석
메이저 놀이터 순위트 염색체 5는 가축화에 중요한 역할을합니다. 후보 유전자 VACYCA3 및 1의 단일 SNP 변이체는 POD 특성과 밀접한 관련이 있으며, 후보 유전자 VAHB15의 단일베이스 SNP 변이체는 성숙 단계와 관련이있다.
그림 4 게놈 전체 연관 분석 및 길 들여진 특성의 선택 간격
VAANR1 및 VABM, 콩 종자 색상의 종자 색상의 종자 색상의 중요한 후보 유전자는 각각 염색체 1 및 염색체 8에서 확인되었다. 일배 체형 분석, OMICS 및 유전자 분석은 VAANR1 유전자의 코딩 서열에서 SNP 변이체가 콩 종자 색상의 종자 색상의 가축을 유발하는 중요한 요소 일 수 있음을 발견했다. 후보 유전자 VABM에 대한 3 가지 일배 체형이 있으며, 그 중 CC 일배 체형은 시드 코트에 검은 반점을 나타내지 않으며 모든 야생 콩 종자 코트에는 어두운 반점이 있습니다.
그림 5 콩 씨앗의 종자 색상의 전체 게놈 분석
베이징 농업 대학 대학원 대학원 대학원생 Chu Liwei (현재 Dalian University의 강사), Yang Kai 교수, Zhao Bo 부교수 및 BGI의 Chen Chunhai 교수, BGI의 공동 저자, Beijing Agricultural College의 Wan Ping 교수 인 Jianbo, Bgi in Bgi의 메이저 놀이터 순위트원 인 Jianbo 교수입니다. 중국 과학 아카데미의 유전학 및 발전에 관한 호주의 Modock University의 Rajeev K Varshney 교수는 공동 대응 저자, 미국 농업부의 Beltsville Agriculture Research Center의 메이저 놀이터 순위트원 송 키지안 및 스완 지 대학교의 Eva C. Sonnenschein 교수는이 메이저 놀이터 순위트에 대한 중요한 지침을 제공합니다. 이 메이저 놀이터 순위트는 National Key R & D Plan, National Natural Science Foundation, Beijing Municipal Education Commission의 주요 프로젝트 및 베이징 농업 대학과 같은 프로젝트에 의해 자금을 지원했습니다. Nanjing Agricultural University의 Academician Gai Junyi와 Yang Shouping 교수는 재료 식재장을 제공하는 데 도움을주었습니다.
메이저 놀이터 순위트팀의 교사와 학생들은 학교의 제 4 차 의회의 정신을 완전히 구현하고, "작업 구현의 해"의 배치 요구 사항을 자세히 구현할 것이며, 과학적 메이저 놀이터 순위트를위한 과학 및 기술 혁신을위한 행동 계획 "에 중점을두고 과학적 메이저 놀이터 순위트를 돕고, 혁신적으로 혁신적으로 혁신을 만들어 내고, 긍정적 인 공동을 만들고, 긍정적 인 공동을 만들어 냈습니다. 중국에서 일류 및 국제적으로 유명한 도시 농업 및 임업 특성.
