최근에 Xiaodou Research 팀은 BGI와 손을 잡고 중국 과학 아카데미의 유전학 및 발달 생물학 연구소와 호주 및 기타 단위의 Modock University와 밀접하게 협력했습니다. 2 세대 및 3 세대 시퀀싱 기술을 사용하고 Hi-C 염색체 보조 조립과 결합 된 Xiaodou Jingnong No. 6 게놈 시퀀싱 및 어셈블리가 성공적으로 완료되었습니다. 동시에, 322 Xiaodou 생식 질 자원이 재정비하고 있었고, 14 개의 농경질 적 특성 표현형이 확인되었고, 전체 게놈 상관 분석을 수행하여 다수의 후보 유전자를 수득 하였다. 우리 졸업생 Chu Liwei, Yang Kai 교수, Zhao Bo 부교수 및 Bgi Chen Chunhai 가이 논문의 공동 저자입니다. 우리 메이저 놀이터 순위의 Wan Ping 교수, BGI의 부교수 Jian Jianbo, 중국 과학 아카데미의 유전학 연구소 및 개발 연구소의 Tian Zhixi 연구원, 호주 Mordock 대학의 Rajeev K Varshney 교수는 논문의 공동 대응 저자입니다. 미국 농무부의 Beltsville 농업 연구 센터의 연구원 인 Song Qijian 연구원과 영국 스완 지 대메이저 놀이터 순위의 Eva C. Sonnenschein 교수는이 연구에 대한 중요한 지침과 지원을 제공했습니다. 이 연구는 National Key R & D Plan, National Natural Science Foundation, Beijing Municipal Education Commission의 주요 프로젝트 및 베이징 농업 대학과 같은 프로젝트에 의해 자금을 지원했습니다. Nanjing Agricultural University의 Academician Gai Junyi와 Yang Shouping 교수는이 연구를위한 재료 재배지를 제공했습니다.
vigna angularis는 중국에서 유래했으며 고대 기능적인 작은 곡물과 전통적인 수출 작물입니다. 가장 초기의 작은 콩 음식은 7,000 년 전에 잔지안의 Qianhuqiao 고고학 유적지에서 발견되었습니다. 콩은 고품질 단백질, 엽산, 철, 아연, 콩 사포닌 및 플라보노이드 및 기타 생물학적 활성 물질이 풍부하며 중국, 일본, 일본, 한국, 인도, 호주, 브라질, 캐나다 등 30 개국 이상에서 자랍니다. 고품질 게놈 시퀀싱, 완전한 게놈 어셈블리 및 게놈 전체 연관 분석을 통해 콩의 적응 메커니즘과 콩 육종의 개선에 대한 연구에 중요한 중요성을 제공 할 수 있으며 다른 콩의 가축화 및 번식 연구에 도움이 될 수 있습니다.
이 연구는 게놈 업데이트를 통해 메이저 놀이터 순위 수준에서 고품질 게놈을 얻었습니다. Contig N50은 약 16MB이고 서열 로딩 속도는 97.8%에 도달했습니다. 32,738 개의 단백질-인코딩 된 유전자는 주석에 의해 얻어졌다.
그림 1 Jingnong No. 6 게놈 어셈블리
연구원들은 비교 유전체학을 사용하여 계보에서 유전자 패밀리의 진화를 연구하고 Xiaodou와 Eleven Other 종 사이에 독특하고 공유 된 유전자 패밀리를 식별하기 위해 포괄적 인 계통 발생 트리를 얻었습니다. Xiaodou의 메이저 놀이터 순위 3 및 5는 골절과 융합을 겪었으며, Xiaodou의 메이저 놀이터 순위 5는 Cowpea 속에 독립적으로 존재하며 별도로 길 들여질 수있는 중요한 간격을 가지고있는 것으로 밝혀졌습니다.
그림 2 작은 콩, 녹두 및 cowpeas의 비교 유전체학 분석
연구팀은 322 개의 야생 콩, 반 야생 콩, 재배 된 콩 국소 품종 및 광범위한 소스를 갖춘 전체 게놈 재정의 분석을 수행하여 중국의 야생 콩이 유전 적 다양성이 높고 가장 즐거움 유형임을 보여줍니다. 중국의 양호트 강의 중간과 하위는 콩의 기원과 길의 중심이되어야한다고 추측된다. 작은 콩의 포괄적 인 게놈 돌연변이 맵이 구성되어 작은 콩의 진화 및 가축화 패턴을 나타냅니다.
그림 3 322 야생 콩 및 재배 콩의 인구 구조 분석
연구를 통해 Xiaodou의 메이저 놀이터 순위 5는 가축화에 중요한 역할을하고 후보 유전자 VACYCA3; 1 단일 SNP 변이체는 POD 특성과 밀접한 관련이 있으며, 후보 유전자 VAHB15G/T 단일베이스 SNP 변이체는 성숙 단계와 관련이 있습니다.
그림 4 게놈 전체 연관 분석 및 길 들여진 특성의 선택 제거
VAANR1 및 VABM, VAANR1 유전자의 코딩 서열에서 종자 색상에 대한 중요한 후보 유전자는 메이저 놀이터 순위 1 및 메이저 놀이터 순위 8 8에서 확인되었다. 일배 체형 분석, omics 및 유전자 분석은 VAANR1 유전자의 코딩 색상에서 중요한 인자가 될 수 있음을 발견했다. VAANR1 유전자의 코딩 서열. 후보 유전자 VABM에 대한 3 가지 일배 체형이 있으며, 그 중 CC 일배 체형은 시드 코트에 검은 반점을 나타내지 않으며 모든 야생 콩 종자 코트에는 어두운 반점이 있습니다.
그림 5 콩 씨앗의 종자 색상의 전체 게놈 분석
연구팀의 교사와 학생들은 메이저 놀이터 순위의 제 4 자의 의회의 정신을 완전히 구현하고, "작업 구현의 해"의 배치 요구 사항을 자세히 구현할 것이며, 과학적 및 기술 혁신을위한 행동 계획에 중점을두고, 과학적 연구와 과학적 연구와 지속적으로 개선되며, 높은 수준의 혁신적 결과를 계속 만들어 내고, 긍정적 인 결과를 계속 만들고, 계속해서, 그리고 계속해서 긍정적 인 결과를 얻었습니다. 중국에서 일류 및 국제적으로 유명한 도시 농업 및 임업 특성을 갖춘 응용 대학.
